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Fév 05 2015

Activité enzymatique

lysosyme

Auteur : Nicolas ESSEIVA – Lycée Xavier Marmier – Pontarlier

 

 

 

Objectifs : Mise en évidence du complexe enzyme substrat. Effet d’une mutation sur l’activité enzymatique.

 

Introduction : Le lysozyme est une enzyme de petite taille qui joue un rôle très important dans l’organisme ; elle intervient dans notre défense vis-à-vis des microbes en découpant certaines de leurs molécules. Cette enzyme est produite par certains globules blancs.

Cette petite étude a pour but de répondre aux problèmes suivants :
– Comment agit l’enzyme ?
– Que se passe t’il si l’enzyme possède des anomalies de structure ?Quelles conséquences cela a t’il?

 

Pour répondre à ces problèmes, nous allons utiliser des représentations 3D de lysozyme :
Une  enzyme fonctionnelle et normale, une enzyme mutée non fonctionnelle et une enzyme mutée mais fonctionnelle.

 
Partie 1: Découverte de l’enzyme; nature de la liaison avec son substrat :
Problème: Comment agit l’enzyme ; Comment agit elle sur son substrat ?

Avec Rastop :

Afficher le lysosyme normal seul
Afficher le lysosyme + son substrat
Coloration l’enzyme (bleue ou blanc) et son substrat (rouge)

lyso1

1°) Rappeler la nature chimique d’une enzyme. A l’aide du logiciel, justifier votre réponse en indiquant en partie la composition des enzymes.

2°) Décrivez la forme de l’enzyme, comment se dispose son substrat par rapport à elle ? Compléter le document 1 distribué en indiquant clairement l’enzyme et le substrat.
Bilan : Réponse au problème.

 

 

Partie 2: Comparaison de 3 enzymes:
Problème: Que se passe t’il si l’enzyme possède des anomalies de structure ?Quelles conséquences cela entraine t’il?

Avec Rastop :

Afficher le lysosyme normal + son substrat
Coloration l’enzyme (bleue ou blanc) et son substrat (rouge)Colorer une zone particulière de l’enzyme
Mettre en évidence l’acide aminé 109 et 125.

lyso2

Afficher le lysosyme muté non fonctionnel
Coloration l’enzyme (bleue)
Colorer la même zone particulière de l’enzyme
Mettre en évidence l’acide aminé 109 et 125.

lyso3

Afficher le lysosyme muté fonctionnel + son substrat
Coloration l’enzyme (bleue ou blanc) et son substrat (rouge)
Colorer une zone particulière de l’enzyme
Mettre en évidence l’acide aminé 109 et 125.
1°) A quoi correspond la zone colorée en jaune dans les 3 enzymes?

2°) Noter le nom (3 lettres) de l’acide aminé 109 et 125 des 3 enzymes.

3°) Expliquer à l’aide de vos connaissances et des observations réalisées sur ces 3 molécules pourquoi l’enzyme mutée est fonctionnelle ou non fonctionnelle.
Bilan : Réponse au problème.

 

telTélécharger le dossier complet (150 Ko)